ইন্টিগ্রেটিভ মেটা-ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স এবং মেশিন লার্নিং টমেটো ব্যাকটেরিয়াল প্যাথোজেনের প্রতিক্রিয়ায় প্রতিরক্ষা নেটওয়ার্ক এবং নিয়ন্ত্রক কেন্দ্রগুলি প্রকাশ করে
টমেটো (সোলানাম লাইকোপারসিকাম) একটি অর্থনৈতিকভাবে গুরুত্বপূর্ণ সবজি ফসল, তবে, এর উৎপাদন ক্ল্যাভিব্যাক্টর মিশিগানেনসিস সাবএসপি সহ ব্যাকটেরিয়াল প্যাথোজেন দ্বারা মারাত্মকভাবে প্রভাবিত হয়। michiganensis (Cmm) এবং Pseudomonas syringae। উদ্ভিদ প্রতিরক্ষা প্রতিক্রিয়াগুলি জটিল হরমোন নেটওয়ার্ক দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়, বিশেষ করে স্যালিসিলিক অ্যাসিড এবং জেসমোনিক অ্যাসিড, যা আংশিকভাবে ওভারল্যাপিং এবং প্রসঙ্গ-নির্ভর সংকেত পথগুলিকে সক্রিয় করে। যদিও অসংখ্য ট্রান্সক্রিপ্টোমিক গবেষণা হরমোন- এবং প্যাথোজেন-সম্পর্কিত প্রতিক্রিয়াগুলি তদন্ত করেছে, টমেটো প্রতিরক্ষার অন্তর্নিহিত সংরক্ষিত ট্রান্সক্রিপশনাল স্বাক্ষরগুলি অসম্পূর্ণভাবে বোঝা যায়। এটি মোকাবেলা করার জন্য, আমরা পাঁচটি পরিপূরক পদ্ধতির (স্থির প্রভাব, র্যান্ডম-ইফেক্ট, র্যাঙ্ক প্রোডাক্ট, স্টফারের জেড-স্কোর, এবং ফিশারের পদ্ধতি) ব্যবহার করে বিশাল RNA-seq ডেটার একটি সমন্বিত মেটা-বিশ্লেষণ করেছি, 178টি আপগ্রেগুলেটেড এবং 177টি ডাউনরেগুলেটেড কনসেনসাস ডিইজি-আরএম-এর প্রতিনিধিত্ব করে। কার্যকরী সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ আমাকে ব্যাপকভাবে প্রকাশ করেছে
এই নিবন্ধ বা এর কিছু অংশ থেকে প্রাপ্ত অভিযোজিত উপাদান শেয়ার করার জন্য এই লাইসেন্সের অধীনে আপনার কাছে অনুমতি নেই। এই নিবন্ধের চিত্র বা অন্যান্য তৃতীয় পক্ষের উপাদান নিবন্ধের ক্রিয়েটিভ কমন্স লাইসেন্সে অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছে, যদি না উপাদানটির ক্রেডিট লাইনে অন্যথায় নির্দেশিত হয়। যদি উপাদান নিবন্ধের ক্রিয়েটিভ কমন্স লাইসেন্সে অন্তর্ভুক্ত না করা হয় এবং আপনার উদ্দেশ্যযুক্ত ব্যবহার বিধিবদ্ধ প্রবিধান দ্বারা অনুমোদিত না হয় বা অনুমোদিত ব্যবহার অতিক্রম করে, তাহলে আপনাকে সরাসরি কপিরাইট ধারকের কাছ থেকে অনুমতি নিতে হবে। এই লাইসেন্সের একটি অনুলিপি দেখতে, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ দেখুন।